Pearl Jam est né des cendres de Mother Love Bone et est devenu l'un des groupes rock américains les plus importants des années 90. Après le décès par surdose du chanteur Andrew Wood en 1990, le guitariste Stone Gossard et le bassiste Jeff Ament décident de partir un nouveau groupe pour remplacer Mother Love Bone. Ils demandent à Mike McCready de chanter et enregistrent un démo en compagnie de Matt Cameron, batteur de Soundgarden. Grâce à Jack Irons, qui va plus tard devenir batteur du groupe, la cassette se retrouve entre les mains d'un surfeur de 25 ans originaire de San Diego, Eddie Vedder. Il enregistre sa voix sur les partitions originales et il est invité à se joindre au groupe qui porte alors le nom de Mookie Blaylock, en l'honneur d'un joueur des Hawks d?Atlanta dans la NBA.
Pour le premier album du groupe, c'est Dave Krusen qui se trouve à la batterie. La formation se renomme ensuite Pearl Jam pour éviter des problèmes légaux et enregistre Ten au début de 1991, le disque n'est toutefois lancé qu'en août. Entre temps, la plupart des membres du groupe participent au collectif Temple of the Dog, un groupe mis sur pied pour rendre hommage à Andrew Wood.
Ten connaît un lent départ et ne commence à susciter de l'intérêt qu'au début de 1992, après que Nirvana eut pavé la voie. Il ne faut pas beaucoup de temps à Pearl Jam pour dépasser la bande à Kurt Cobain au chapitre des ventes. La fusion du rock typique des années 70 et du post-punk des années 80 jumelée à un talent marqué pour les refrains séduit le public qui craque pour Even Flow, Jeremy et Alive.
Peu de temps après la sortie de Ten, Dave Krusen décide de quitter et est remplacé par Dave Abrruzzese, la valse des batteurs vient de commencer. Au cours de l'année 1992, le public de Pearl Jam ne cesse d'augmenter grâce, entre autres, à la tournée Lollapalooza et à la bande originale du film Singles dans lequel le groupe joue aussi un petit rôle. Malgré son statut de superstar, la formation hésite à jouer selon les règles établies par l'industrie. Ainsi, Pearl Jam refuse de lancer un extrait ou de faire un vidéoclip en marge du lancement de son second disque, Vs., qui paraît en 1993. Publicité ou non, l'album s'écoule à plusieurs millions d'exemplaires en plus d?entrer directement en première position du palmarès de Billboard dès sa première semaine, semaine au cours de laquelle près d'un million d'exemplaires de Vs. sont vendus.
Au cours de l'été 1994, Pearl Jam défie encore une fois les conventions de l'industrie en annulant tout bonnement sa tournée. Raison invoquée? Il leur est impossible de maintenir le prix des billets sous la barre des 20$ parce que le distributeur Ticketmaster pousse les promoteurs à augmenter le prix. Le groupe décide de poursuivre Ticketmaster prétextant des pratiques commerciales illégales. Cela n'empêche pas la formation de poursuivre le travail sur un troisième opus qui est enregistré au cours de cet été-là. Après la fin de l'enregistrement, le groupe congédie Dave Abbruzzese, le remplaçant par un ami, Jack Irons anciennement des Red Hot Chili Peppers et Eleven.
Vitalogy, le troisième album de Pearl Jam, est lancé à la fin de 1994. Pendant les deux premières semaines, le disque n'est disponible qu'en format vinyle, ce qui ne l'empêche pas de se trouver une place dans le Top 60 de Billboard. Deux semaines plus tard, quand les CD et cassettes font leur apparition, Vitalogy est propulsé au sommet du palmarès et est rapidement certifié Platine à plusieurs reprises. Pendant ce temps, la dispute se poursuit avec Ticketmaster. En 1995, le ministère américain de la justice tranche finalement en faveur de la billetterie. Pendant ce temps, Pearl Jam ne chôme pas et enregistre l'album Mirror Ball en compagnie de Neil Young.
De son côté, Eddie Vedder se permet une petite tournée avec Hovercraft, le groupe expérimental de sa femme Beth. Stone Gossard, quant à lui, fonde sa propre compagnie de disques en plus de jouer avec son autre groupe, Brad. Mike McCready se tient lui aussi occupé puisqu?il lance l?album « Above » en compagnie de Lane Staley, chanteur d?Alice in Chains.
Au cours de l?été 1996, Pearl Jam y va d'un quatrième album intitulé No Code qui est accueilli favorablement par la critique. Bien que le disque amorce sa carrière au sommet du palmarès, son étrange mélange de rock, de musique du monde et d'expérimentations sonores déplait à plusieurs fans de sorte que le disque dégringole au Billboard. De plus, Pearl Jam ne fait pas de tournée majeure pour soutenir le disque principalement en raison de la dispute qui les oppose à Ticketmaster et parce que la formation hésite à dépenser d'importantes sommes d?argent sur la route.
Pearl Jam passe la majeure partie de 1997 dans l'ombre à concocter un nouveau disque. Gossard en profite pour produire un second album avec Brad. Yield, le cinquième disque de Pearl Jam paraît en février 1998. Yield propose un retour aux racines rock du groupe, décision qui est bien reçue par les critiques, mais qui ne convainc pas les fans. Une fois les purs et durs ayant acheté leur exemplaire, le disque quitte la deuxième position du Billboard en route vers une longue chute. La bande à Eddie est toutefois de retour en tournée et en profite pour enregistrer l'album Live on Two Legs à la fin de 1998. Au cours de la tournée, le groupe vit un nouveau changement de batteur alors que Jack Irons doit abandonner pour des raisons de santé. Il est remplacé par Matt Cameron dont le groupe Soundgarden vient de se séparer.
En 1999, Pearl Jam récolte un succès radio inattendu avec la reprise Last Kiss de J. Frank Wilson. Pourtant, la chanson n'avait été offerte qu'aux membres du fan-club, mais la demande est telle que Pearl Jam n'a d?autre choix que de proposer la chanson à un public plus large. Néanmoins, Last Kiss est le plus gros succès pop du groupe à ce jour, se hissant au second rang du palmarès Billboard et étant certifié Or.
Pearl Jam lance un nouvel opus intitulé Binaural en 2000. Au cours de la tournée qui suit, le groupe trouve une façon pour le moins originale de contrer les pirates en lançant un album live pour chacun des 72 concerts des tournées nord-américaine et européenne.
En 2002, Pearl Jam déstabilise les critiques et les fans avec Riot Act. Au cours de la tournée qui suit en 2003, la formation a encore une fois l'intention de lancer un album live pour chaque spectacle en l'offrant directement aux fans par l'entremise de son site Web. L'album sera disponible pour écoute le lendemain du spectacle et ceux qui désirent se le procurer peuvent l'acheter à l'avance pour le recevoir par courrier quelques jours plus tard. En novembre 2003, le groupe propose une compilation de pièces rares et inédites intitulée Lost Dogs: Rarities and B Sides.
Pearl Jam renoue avec le sommet du palmarès en 2006 avec un album éponyme. En 2009, le groupe souligne son vingtième anniversaire en rééditant ses premiers albums en version de luxe. Au cours de l'automne, l'album Backspacer est lancé et entre directement au premier rang du palmarès de Billboard.
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