Anti-Flag est formé à Pittsburgh en 1993 par le chanteur et guitariste Justin Sane, le bassiste Andy Flag et le batteur Pat Thetic. Le groupe se donne immédiatement comme mission de dénoncer la religion, le nationalisme et le fascisme. Anti-Flag se gagne rapidement des fans dans la région de Pittsburgh et tourne même à la radio.
En 1997, après avoir lancé quelques simples et avoir vu Andy Flag quitter, le groupe lance « Die for the Government » qui s’écoule à 20 000 exemplaires. Quatre bassistes et quatre tournées nationales plus tard, Anti-Flag s’est forgé une solide réputation d’ambassadeurs du punk de la belle époque avec une rapide, forte et grossière qui s’élève contre tout ce qui finit en « isme ».
En 1997, Chris Head devient bassiste à temps plein et en 1999, Chris #2 est ajouté au groupe pour en faire un quatuor. Défendant ses positions, Anti-Flag lance sa propre étiquette, A-F Records, qui édite l’album « Their System Doesn’t Work for you » en 1998.
En 1999, Anti-Flag lance « A New Kind of Army », un disque coup de poing qui vise à véhiculer les valeurs du groupe tout en lui permettant de rejoindre un plus large public. La formation décroche le gros lot en participant à la tournée Vans Warped où il rencontre Fat Mike de NOFX, propriétaire de l’étiquette indépendante Fat Wreck Chords.
L’étiquette offre un contrat à Anti-Flag et édite l’album « Underground Network » en 2001. La moitié des chansons de l’album suivant, « Mobilize », est enregistrée lors d’un concert à Pittsburgh, en décembre 2001. Lancé en février 2002, le disque reflète les événements récents des attaques terroristes contre les tours du World Trade Center de New York.
En 2003, le groupe lance « The Terror State » qui remporte un fort succès sur la scène punk. Pendant ce temps, Anti-Flag s’implique au sein d’organisations qui incitent les jeunes à aller voter lors de l’élection présidentielle de 2004. Le groupe agit également comme tête d’affiche de la tournée Rock Against Bush. En avril 2005, Anti-Flag prend un peu tout le monde par surprise en signant une entente avec l’étiquette majeure RCA. En mars 2006, l’album « For Blood and Empire » est lancé.
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